肽檢測限是多少?在典型的蛋白質組學分析中可以檢測到多少種蛋白質?
沒有一個通用的數字可回答這個問題。可檢測蛋白質的數量取決於樣品的複雜性、蛋白質濃度的動態範圍、可用材料和使用的 LC-MS 儀器等因素。單次質譜執行中可檢測的蛋白質範圍可以從幾個蛋白質到幾百或上千個不等。 當前最先進的質譜儀的一般檢測極限在亞飛摩爾(sub-femtomol)和阿託摩爾(attomol )範圍。 然而,肽的實際檢測限會隨著其在MS儀器中的所謂“飛行性(flyability)”而變化。肽的飛行能力取決肽序列長度和組成、電離效率和碎片特性等幾個特性。通常,蛋白質的某些肽“飛”得很好,因此在結果中非常豐富,而其他肽倘若不能很好地離子化,則永遠不會被檢測到。
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