生信分析中序列覆蓋率(Sequence coverage)是什麼?
序列覆蓋率((Sequence coverage))是識別蛋白質中氨基酸數量的百分比值。 如果鑑定的肽在1.000個氨基酸長的蛋白質中覆蓋200個殘基,則序列覆蓋率為 20%。序列覆蓋率可以從0%到100%不等,通常不會在樣品中檢測到所有屬於蛋白質的肽段。這取決於許多因素,例如蛋白質序列、蛋白質長度、樣品中的丰度、樣品的複雜性等。 已識別(覆蓋)的氨基酸以綠色突出顯示,經修飾鑑定的氨基酸以紅色突出顯示,黑色則表示氨基酸沒有被識別。
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