什麼是蛋白質推斷？

當針對肽序列資料庫搜尋MS / MS譜時，在大多數情況下，匹配的肽並不是單個蛋白質所獨有的。然而，我們通常想知道樣品中存在哪些蛋白質。因此，我們面臨著蛋白質推斷的挑戰：給定一組肽匹配，我們認為樣品中存在哪些蛋白質？通常的方法基於“簡約原則”。我們報告瞭解釋觀察到的肽匹配的最小蛋白質集。如果我們有四個肽匹配，其中兩個發生在蛋白A中，兩個發生在蛋白B中，但所有四個都存在於蛋白C中，我們則認為蛋白C已被鑑定。蛋白質A和B可能被列為“子集”蛋白質。我們的樣品完全有可能實際上含有蛋白質A和B的混合物，但沒有證據能證明這一點。

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