什麼是鳥槍法（Shotgun）蛋白質組學？

在鳥槍法（Shotgun）蛋白質組學中，蛋白質被蛋白水解酶消化為肽段。質譜儀一次只能檢測有限數量的肽，因此在進行 MS 分析之前，先將複雜的肽混合物在 nano-HPLC 上進行分離。從LC中洗脫得到的肽被噴射到MS中，並在電噴霧電離（ESI）過程中被高壓電離為帶電分子。電離是必不可少的，因為質譜儀只能檢測帶電分子。從LC中洗脫的肽經一級質譜分析後可獲取其質譜資訊（MS光譜），並選擇高丰度肽用於片段化和後續分析（MS/MS光譜）。每個單一的MS/MS譜圖都在一個由生物體蛋白質組的理論質譜組成的資料庫中進行搜尋，資料庫根據匹配的質量進行評分，使所有鑑定出的肽匹配到相對應的蛋白質中。

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