我該如何選擇蛋白質樣品LC-MS/MS分析的執行時間？

如果您的蛋白樣品只含單一蛋白質或含多達50個等摩爾質量的蛋白，並且需要進行蛋白質鑑定，則30分鐘的執行時間就足夠了。如果您是IP樣品，並期望檢測出約100種蛋白質，那麼我們建議60分鐘的執行。如果您期望尋找翻譯後修飾位點（PTM），我們建議至少執行60分鐘。如果您的樣品是含有數百種蛋白質的蛋白混合物，那麼我們建議執行2小時。如果您想要進行細胞裂解，建議2-4小時。上述所有建議都是基於有足夠的鑑定原材料，且要求總蛋白含量≥1μg。如果總蛋白質含量極少，則延長執行時間將沒有任何意義。

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