SWATH定量—SWATH採集透過依次分析視窗來獲取資料。通常情況下，資料是如何獲取的？

通常情況下，或在IDA模式下，資料是在調查掃描後獲得的。調查掃描確定了40個最強的離子，並且只對這些離子進行破碎。這意味著在固定的時間點，唯一被碎片化的離子是選定的最強烈的離子。在SWATH的1個週期內，所有視窗都是按順序獲取的。例如：假設我們想要覆蓋從 350-1250 m/z 的一系列離子。視窗 #1 的範圍可以從 350-352.4 m/z。質譜儀將碎裂所有適合此視窗的離子（強或不強）。結果將是與 350-352.4 m/z 視窗內的所有前體相關的 MS/MS 片段的混合。然後，質譜儀將從視窗 #2 分離和破碎離子，例如從 352.4 到 356.1 m/z 並記錄它們的 MS/MS 碎片，依此類推，直到第 200 個視窗。

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