應該如何準備2D電泳的樣品進行質譜分析?

    首先,重要的是要知道2D PAGE的蛋白質樣品不應含有高鹽濃度,SDS等離子洗滌劑或細胞裂解產生的細胞碎片和DNA。這些會干擾等電聚焦(IEF)並導致凝膠中出現斑點條紋。確保蛋白質濃度約為1-20ug /ul。對於含有許多蛋白質的複雜樣品,每個凝膠上的蛋白質上樣量應約為50-300微克,純蛋白質樣品的蛋白質上樣量應約為5-50微克。此外,對於透過質譜鑑定蛋白質,凝膠可以透過標準的考馬斯染色方法或透過針對MS蛋白質ID最佳化的更靈敏的銀染色方法進行染色。


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