靶向蛋白質組學和非靶向蛋白質組學
蛋白質組學根據研究目標是否是針對特定的蛋白質可以分為靶向和非靶向蛋白質組學。靶向蛋白質組學,針對特定的目標蛋白質進行研究;非靶向蛋白質組學,針對全域性檢測儘可能多的蛋白質。百泰派克生物科技提供基於質譜的靶向蛋白質組學和非靶向蛋白質組學分析服務。
非靶向蛋白質組學也稱為發現蛋白質組學,旨在發現並檢測樣品中更多的蛋白質,從而發現新的蛋白質和生物標誌物等。非靶向蛋白質組學的出現早於靶向蛋白質組學,適合於生物標誌物發現的早期研究階段。基於質譜的非標記(Label Free)定量蛋白質組學、SILAC定量蛋白質組學、TMT/iTRAQ定量蛋白質組學,以及SWATH定量蛋白組學等都屬於非靶向蛋白質組學。
Bostanci N, et al. Molecular & Cellular Proteomics, 2018
在非靶向蛋白質組學研究中發現感興趣的特定蛋白質或生物標誌物之後,可進一步透過靶向蛋白質組學的方法,在更多的樣本中驗證和研究這些蛋白質。相比於非靶向蛋白質組學,靶向蛋白質組學有更好的準確性、靈敏度和重現性。靶向蛋白質組學技術主要包括MRM(multiple reaction monitoring)和PRM(parallel reaction monitoring),其中MRM也稱為SRM(selected reaction monitoring),它們可以更靈敏的檢測低丰度的多肽片段並有更高的定量精度,從而驗證和確認非靶向蛋白組學發現的蛋白質以說明生物學差異。
相關服務
基於SILAC的蛋白組定量
基於TMT/iTRAQ的蛋白質組定量
label free定量
SWATH技術
MRM/PRM定量蛋白組學分析
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