DIA蛋白組學和iTRAQ蛋白組學
DIA蛋白組學是利用DIA技術（如SWATH）研究蛋白組，iTRAQ蛋白組學是利用iTRAQ技術研究蛋白組。百泰派克生物科技提供SWATH蛋白組學和iTRAQ蛋白組學分析服務。
DIA蛋白組學
DIA是一種質譜採集技術，DIA蛋白組學是指利用資料非依賴採集（data-independent acquisition，DIA）技術研究蛋白質組。在DIA模式下，對於每個迴圈，儀器都將聚焦在狹窄的母離子質量視窗上，並從該視窗內檢測到的所有母離子中獲取MS / MS資料。然後，此質量視窗跨越整個質量範圍，系統地從每個質量和所有檢測到的母離子中收集MS / MS資料。即不預先對母離子進行篩選，以獲得所有離子的碎片資訊。DIA中最常見的一種方法為SWATH。SWATH技術可以不用進行樣品的標記而對樣品蛋白進行定量，能夠對複雜樣品中幾乎所有可檢測的分子進行定量測定。
iTRAQ蛋白組學
iTRAQ蛋白組學是指利用iTRAQ（isobaric tag for relative and absolute quantitation）技術研究蛋白質組，iTRAQ是一種資料依賴採集（data-dependent acquisition，DDA）的質譜採集技術。在iTRAQ中，需要用iTRAQ試劑對樣品進行差異標記，不同樣品的同一肽段在一級質譜中質譜峰相同，選定對應質譜峰進行碎裂，在二級質譜中不同樣品的同一肽段因標記時報告基團不同而可以區分開，透過它們的質譜峰訊號強弱即可進行定量。iTRAQ蛋白組學可在一次實驗時同時比較多種樣品中的蛋白質的相對和絕對含量。
DIA蛋白組學和iTRAQ蛋白組學
DIA蛋白組學和iTRAQ蛋白組學比較
相對於iTRAQ，DIA不會造成低丰度蛋白資訊的丟失，定量準確度較高，資料可重現性較高，但無法直觀的看到二級質譜圖中的碎片來自哪一個母離子。而iTRAQ可以直接看到二級質譜圖中的碎片來自哪一個母離子，且可以同時分析多個樣品。在實驗時，研究者可以根據自己的實際情況進行選擇。
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