鳥槍法蛋白組學
鳥槍法蛋白質組學是基於液相色譜和質譜技術的一種分析蛋白質組的方法,擺脫了傳統凝膠分離技術的侷限和不足。百泰派克生物科技提供鳥槍法分析蛋白質組的服務。
鳥槍法蛋白組學
鳥槍法(shotgun)蛋白質組學是指將自下而上(bottom-up)的蛋白質組學技術結合使用高效液相色譜與質譜聯用來鑑定複雜混合物中的蛋白質。該名稱源於DNA的鳥槍法(shotgun)測序。鳥槍法蛋白質組學最常用的方法是從消化混合物中的蛋白質開始,然後透過液相色譜法分離得到的肽段,接著使用串聯質譜法鑑定肽段。鳥槍法蛋白質組學允許鑑定樣品全部蛋白質,並具有系統分析動態蛋白質組的能力。它還避免了與完整蛋白質分析相關的中等分離效率和較差的質譜靈敏度。常見的label free、SILAC和iTRAQ定量蛋白質組學分析都是基於鳥槍法進行的。
鳥槍法蛋白組學流程
鳥槍法蛋白組學實驗中,首先是從樣品中提取蛋白質,並用蛋白酶消化以產生肽段混合物。然後將肽混合物直接上樣到液相色譜柱上進行分離,分離後的肽段經電離成為離子,最後進入串聯質譜(MS/MS)進行解析。利用計算機根據設定好的運演算法則分析所得資料,可以從理論蛋白質資料庫中檢索出測得的肽段對應的蛋白質,從而確定樣品中的蛋白質成分。
鳥槍法蛋白組學
相關服務:
定量蛋白組分析
基於Label Free的定量蛋白組分析
基於SILAC/Dimethyl標記的定量蛋白組分析
TMT/iTRAQ/MultiNotch定量蛋白組學分析
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