單細胞分析FAQ彙總

• • 單細胞測序是幹什麼的？

  單細胞測序（Single-cell sequencing）是一種在單個細胞水平上進行基因組、轉錄組或表觀組分析的高通量測序技術。傳統的測序方法通常對一組細胞的總體進行分析，而單細胞測序技術能夠揭示細胞群體中個體細胞的差異。這對於深入瞭解細胞發育、組織中不同細胞型別的功能以及疾病發生和進展的機

• • 單細胞測序要用幾個樣本啊，沒錢測很多怎麼辦？

  單細胞測序實驗的樣本數量取決於您的研究目標、實驗設計和預算。理想情況下應該使用盡可能多的樣本來確保結果的統計學意義和代表性。然而，單細胞測序的成本可能會限制實驗中使用的樣本數量。在這種情況下，您可以採取以下策略來權衡成本和資料質量：

• • 單細胞測序資料分析必須要有對應的Marker基因進行鑑定嗎？

  單細胞測序資料分析並不一定需要依賴已知的marker基因來進行鑑定。然而，已知的marker基因可以幫助識別和解釋資料中的細胞型別。在單細胞RNA測序資料分析中，常見的步驟包括質量控制、標準化、降維、聚類和差異表達基因分析等。這些步驟可以在沒有已知marker基因的情況下完成。

• • 質譜流式技術和單細胞基因測序哪種更具優勢？

  質譜流式技術（Mass Cytometry，也被稱為CyTOF）和單細胞基因測序都是單細胞分析的重要技術。它們在不同的方面具有各自的優勢，具體取決於研究問題和目標。

• • 現代生命科學領域，單細胞測序這樣的高通量技術的優勢具體體現在哪裏？

  單細胞測序技術在現代生命科學領域具有顯著優勢，這些優勢主要體現在以下幾個方面：1.解析細胞異質性：傳統的測序技術通常基於細胞群體，無法捕捉到個體細胞之間的差異。單細胞測序技術可以對每個細胞進行獨立分析，從而揭示細胞間的異質性，提供更精細的生物學資訊。

• • 單細胞RNA測序時，已有cluster marker gene，如何鑑定cluster的細胞型別？

  在單細胞RNA測序資料分析中，獲得cluster marker gene是鑑定細胞型別的關鍵一步。以下是根據cluster marker gene鑑定細胞型別的常用方法：

• • 10X 單細胞轉錄組的測序資料量很少，是什麼原因導致的？

  10X單細胞轉錄組測序資料量較少可能是由多種因素導致的。以下是一些可能的原因：1.損失低丰度轉錄物：在單細胞轉錄組測序過程中，細胞中的mRNA數量有限，特別是低丰度的轉錄物更容易在實驗過程中丟失。此外，在cDNA合成和擴增階段，低丰度的轉錄物可能受到擴增偏差的影響，導致資料量較少。

• • 如何看待單細胞測序及轉錄組測序的可重複性和指導意義？

  單細胞測序和轉錄組測序在生物學研究中具有重要價值，它們為我們提供了關於細胞和組織的詳細資訊。然而，在評價這些技術的可重複性和指導意義時，我們需要關注幾個方面：

• • 單細胞轉錄組測序得到的發育軌跡是細胞分化軌跡還是個體發育軌跡？

  單細胞轉錄組測序得到的發育軌跡主要是細胞分化軌跡。單細胞轉錄組測序透過分析單個細胞的基因表達模式，可以揭示不同細胞型別之間的轉錄調控關係以及在發育過程中的時空表達模式。這種技術能夠捕捉到細胞在分化過程中的狀態和基因表達變化，從而繪製出細胞分化的軌跡。

• • 什麼是單細胞轉錄組學測序技術？

  單細胞轉錄組學測序技術（single-cell transcriptomics sequencing）是一種研究單個細胞內基因表達的高通量測序方法。與傳統的轉錄組學測序技術不同，單細胞轉錄組學測序技術可以為每個單獨的細胞提供詳細的基因表達資料，從而揭示細胞群體中的異質性和功能差異。這種技術在