單細胞分析FAQ彙總
-
將根據單細胞測序資料分類得到的markers與已知類群marker基因進行匹配。如果匹配到某個類群裡有已知的marker，就能對這些類群進行已知型別標記。相關服務:單細胞測序
-
單細胞轉錄組測序最主要的目的是可以進行細胞定義，此外，還可以利用該資料進行轉錄因子預測、擬時序分析、細胞互作預測和功能富集等分析。相關服務:單細胞測序
-
單細胞RNA-Seq提供數千個單個細胞的轉錄分析。這種通量分析水平使研究人員能夠在單細胞水平上了解異質樣品中數千個細胞表達的基因，表達量以及它們之間的差異相關服務:單細胞測序
-
• 單細胞RNA測序與傳統和超低輸入的RNA測序有什麼區別？
標準RNA測序可以檢測所有細胞平均轉錄狀態，傳統RNA測序的不足是單個細胞和細胞亞群的解析度丟失。單細胞RNA測序使研究人員不僅能夠識別細胞亞群，而且能夠在異質樣本中的單細胞水平上對其進行全面分析。與標準RNA測序類似，超低輸入RNA測序提供整個細胞群體的批次表達分析；但是其通量非常有限，低
-
首先對樣品進行活細胞計數以及存活率測量，爲了確保最高質量的資料，必須儘快在10x Genomics Chromium系統上處理細胞。相關服務:單細胞測序
-
當然會，細胞存活率低通常會導致測序目標丟失和結果不理想。此外，死亡或凋亡細胞釋放的RNA會增加背景噪音，影響資料質量。爲了使單細胞測序中有用的資料量最大化，必須將死亡細胞的比例降到最低。建議細胞存活率超過90%，最低為70%。存活率低於70%的樣品可進行死細胞去除。相關服務:單細胞測序
-
使用與膜聯蛋白V抗體結合的磁珠清除死細胞。珠子可以捕捉死細胞從而豐富活細胞樣本。相關服務:單細胞測序
-
• 10X Chromium系統每個樣本可以測序多少個細胞？
要揭示一個組織或細胞群體中基因表達的完全多樣性，通常需要對成百上千的活細胞進行分析。研究人員可以靈活地指定要測序的細胞數量，從每個樣本500個細胞到10000個細胞。通常建議在大多數實驗中，每個樣本針對3000個細胞比較合適。相關服務:單細胞測序
-
所需的讀取次數取決於基因組大小、已知基因的數量、細胞型別和轉錄本。通常，我們建議每個細胞讀取 100，000 次，以最大限度地識別轉錄本。相關服務:單細胞測序
-
資料使用10x Genomics 的Cell Ranger軟體進行分析，包括讀取對齊、特徵條碼矩陣、數字基因表達矩陣、聚類、基因表達分析以及t-SNE預測。相關服務:單細胞測序
How to order?
