液質檢測蛋白質操作流程的第一步樣品準備是提取蛋白吧,有詳細介紹嗎,比如我的樣品就是普通的液體,外源性新增蛋白質,我應該怎麼處理
在液質檢測(Liquid Chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS)蛋白質分析的操作流程中,樣品準備確實是非常重要的第一步。對於普通液體樣品中外源性新增的蛋白質,一般的處理步驟如下:
一、樣品收集與儲存:
首先確保樣品在收集後立即冷凍儲存,避免蛋白降解。
二、蛋白質提取:
1.準備緩衝液:
使用PBS(磷酸鹽緩衝鹽溶液)或RIPA緩衝液(這種緩衝液含有蛋白酶抑制劑,可以防止蛋白質降解)。
如果使用RIPA緩衝液,根據需要可以在使用前加入新鮮的蛋白酶抑制劑。
2.樣品與緩衝液混合:
根據樣品的性質和體積,新增適量的緩衝液。一般情況下,可以使用1:1或1:2的樣品對緩衝液比例。
輕輕振搖或翻轉管子,以確保樣品和緩衝液充分混合。
3.破碎細胞(如果需要):
如果樣品中的蛋白質被細胞膜包裹,可以使用超聲破碎、高壓同質等方法打破細胞膜,釋放蛋白質。
控制破碎過程中的時間和強度,避免過度處理導致蛋白質降解。
4.離心去除不溶物:
在冷凍離心機中,使用高速離心(例如,10,000-15,000 g,4°C,10-20分鐘)來沉澱不溶物。
小心地轉移上清液到新的管中,避免擾動沉澱物。
三、蛋白質濃度測定:
使用Bradford、BCA或其他蛋白質濃度測定方法確定蛋白濃度。
四、蛋白質純化:
如果需要,可以透過離心、凝膠過濾、親和層析等方法進一步純化蛋白質。
五、樣品儲存:
如果不立即進行下一步實驗,可以將樣品分裝在低溫(如-20°C或-80°C)中儲存。
這個過程可以根據實驗的具體要求進行適當調整。例如,不同型別的樣品可能需要特定的處理方法,或者在某些步驟中可能需要額外的緩衝液或試劑。
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