質譜結果回來後怎麼分析,怎麼找到互作蛋白
- 質量校準:根據已知標準對質譜資料進行質量校準,確保測量準確。
- 峰檢測:識別和整合質譜圖中的離子峰,為蛋白質/肽段鑑定做準備。
- 資料庫搜尋:使用諸如Mascot、SEQUEST或MaxQuant等軟體,將實驗中得到的肽段質譜資料與蛋白質資料庫進行匹配,以鑑定樣品中的蛋白質。
- 假陽性率控制:應用統計方法(例如FDR, False Discovery Rate)來控制假陽性鑑定。
- 標記或非標記方法:根據實驗設計(如標記(如iTRAQ、TMT)或非標記(如標籤自由))進行定量分析。
- 資料歸一化:調整實驗間變異,確保資料可比性。
質譜資料通常包括資料預處理、蛋白質鑑定、定量分析:
1. 資料預處理
2. 蛋白質鑑定
3. 定量分析
質譜不能直接用於尋找與目標蛋白相互作用的蛋白質,如果是先進行了IP、Co-IP、WB等實驗,再利用質譜鑑定蛋白混合的話,那麼鑑定到的蛋白就是與靶蛋白共同沉澱的蛋白質了。
百泰派克生物科技--生物藥物表徵,多組學生物質譜檢測優質服務商
相關服務:
提交需求
How to order?