做酵母BY4741，庫裡只有酵母S288C，這個可以作為轉錄組測序的參考基因組嘛？

BY4741和S288C都是酵母Saccharomyces cerevisiae的常見實驗菌株。S288C是酵母的參考菌株，它的基因組序列是最先被測定的，並且在很多基因組工具和資料庫中被廣泛使用作為參考。而BY4741是一個從S288C衍生出的haploid菌株，用於多種基因組學研究，包括基因敲除實驗。

如果你要進行轉錄組測序（RNA-Seq）並需要一個參考基因組進行比對，S288C確實可以作為BY4741的參考基因組。實際上，當你在文獻中查詢關於BY4741的研究時，你會發現許多研究都使用S288C作為參考。

然而，要注意的是，儘管BY4741和S288C在基因組層面非常相似，但由於某些特定的基因敲除或突變，它們之間可能存在微小的差異。在大多數應用中，這些差異可能不會導致問題，但如果你的研究聚焦於特定的基因或基因區域，那麼最好確認你的參考基因組與你的實驗菌株之間不存在重大差異。