KEGG通路分析中P值校正後的FDR是表示富集程度高還是p值小,我只知道圓點大表示蛋白質數量多,不太懂FDR的意思

    FDR是多重假設檢驗中的一個概念,用於控制錯誤發現的比率。在進行大量的假設測試時(例如,檢查數千個基因是否與某種疾病相關),我們可能會得到許多統計上顯著的結果,但其中一些可能只是偶然的。爲了控制這種假陽性,我們使用FDR。它的值在0到1之間,FDR越低,表示通路富集的信度越高。

     

    所以,FDR表示的是信度,而不是富集程度或P值的大小。一般來說,FDR越小,表示該通路的富集結果越可靠。在KEGG通路分析中,你應該關注那些FDR值較小的通路,因為它們更可能是真正與你的研究相關的通路。

     

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