PLS-DA/OPLS-DA二維圖是用什麼軟體做的
1.R 語言:
R 語言是一個強大的統計計算和圖形化軟體,透過使用“mixOmics”包或“ropls”包等,它可以執行PLS-DA和OPLS-DA分析,並生成二維圖。
2.MetaboAnalyst:
這是一個線上工具,提供了一系列用於代謝組學資料分析的複雜工具,包括偏最小二乘判別分析(PLS-DA)和正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)。
3.SIMCA:
這是一款由Sartorius Stedim Biotech開發的專業多變數分析軟體,專門用於多後設資料分析,如PCA(主成分分析)、PLS-DA和OPLS-DA。它可以建立詳細的統計模型,並生成易於解釋的圖形結果,如二維得分圖或負荷圖。
4.MATLAB:
MATLAB是一種用於演算法開發、資料分析、視覺化和數值計算的高階語言和互動式環境。透過特定的工具箱和函式,可以執行OPLS-DA分析。
5.Python:
Python是一種程式語言,提供了多種庫(如scikit-learn、PyChem、pandas等)來進行復雜的資料分析。透過如scikit-learn、matplotlib等庫,Python也可以用來進行OPLS-DA分析和繪圖,儘管它可能不如其他專用工具那麼直觀。
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