怎麼看蛋白組學質譜資料呢
- 多荷載離子系列：相鄰峰之間的m/z差異，對應於一個或多個質子的質荷。
- 同位素分佈：每個峰後面通常跟隨一系列較小的峰，反映了同位素離子。
- b和y離子系列：碎片離子通常在蛋白質/肽段的氨基酸側鏈間斷裂，形成b和y離子。
- 中性丟失：查詢是否有通常的中性丟失，如水分子或氨分子的丟失。
- 裂解部位：考慮肽段的可能裂解部位，幫助理解碎片離子的來源。
蛋白組學質譜資料是透過質譜儀獲得的資料，用以分析蛋白質組成和結構。觀察和解釋蛋白質組學的質譜圖（Mass Spectra）需要理解質譜圖的基本組成和特徵。
一、質譜圖的基本特徵
1.X軸：
表示m/z（質荷比）。
2.Y軸：
表示強度（通常是相對強度，不同質譜圖之間不直接比較）。
二、常見的質譜圖型別
1.MS1（一級質譜）：
顯示一個蛋白質/肽段被離子化後的所有單一荷載離子的質荷比m/z和相應的強度。
2.MS2（二級質譜）：
展示一個特定前體離子（來自MS1的一個特定峰）的碎片離子的m/z和強度。
三、觀察和解釋步驟
1.檢查MS1譜圖
2.檢查MS2譜圖
四、解釋和鑑定
1.資料庫匹配：
利用MS2中的碎片離子資料與資料庫中預測的碎片進行匹配，進行蛋白質/肽段的鑑定。
2.肽段配對：
透過配對MS2譜圖與候選肽段，找到最佳匹配。
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