請問如何製備磷酸質譜的樣品呢
磷酸化蛋白的樣品製備對於後續的質譜分析是至關重要的,其大致步驟如下:
1. 蛋白提取:
(1)使用適合的緩衝液從細胞或組織中提取總蛋白。
(2)為防止蛋白酶的活性,可加入蛋白酶抑制劑。
(3)為防止磷酸化位點在提取過程中喪失,使用磷酸酯酶抑制劑是很重要的。
2. 蛋白純化和濃縮:
(1)可透過超濾、離心等方法進行蛋白濃縮。
(2)也可以使用免疫沉澱或親和層析進一步純化特定的蛋白或蛋白複合體。
3. 蛋白酶消化:
通常使用Trypsin進行蛋白酶消化,將蛋白分解為肽段。
4. 磷酸化位點富集:
由於磷酸化蛋白或肽段在樣品中的丰度通常很低,因此需要透過親和層析方法(如金屬螯合層析或免疫沉澱)富集磷酸化肽段。
5. 液相色譜分離:
使用高效液相色譜(HPLC)進行肽段的進一步分離和洗脫。
至此,得到的肽段就可以進行質譜上樣了。
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