GST pull-down蛋白相互作用分析:親,這個有具體步驟嗎?
GST pull-down是一種常見的蛋白質相互作用研究方法。其原理是GST標籤能與還原型谷胱甘肽(GSH)緊密結合,在GST pull-down實驗中,就是利用這種特性,將一個蛋白質("bait"蛋白)與GST標籤融合,然後透過GST標籤和谷胱甘肽的結合將目標蛋白固定在谷胱甘肽覆蓋的珠子(比如谷胱甘肽瓊脂糖珠子)上,再加入其他蛋白("prey"蛋白),如果這些蛋白和固定的蛋白有相互作用,那麼它們就會被一同拉下(pull down),然後透過洗滌去掉不結合的蛋白,留下結合的蛋白,進一步進行分析。
以下是進行GST pull-down實驗的大致步驟,希望可以幫到您:
一、表達和純化GST融合蛋白:
你需要將目標蛋白(bait蛋白)的基因克隆到含有GST標籤的質粒中,然後將其轉化到大腸桿菌或酵母等表達系統中。經過一定時間的表達後,收集細胞,然後破碎細胞以釋放蛋白。蛋白的純化是透過利用GST蛋白與谷胱甘肽的親和力,經過洗滌和洗脫步驟後獲得。
二、製備細胞提取物:
將你希望進行相互作用檢測的細胞或組織(含有可能與bait蛋白相互作用的prey蛋白)破碎,製備成細胞提取物。
三、GST pull-down:
1.將純化的GST融合蛋白和細胞提取物混合在一起,孵育一段時間(通常是在4°C下孵育幾小時或過夜),使得有可能的蛋白-蛋白相互作用發生。
2.新增谷胱甘肽覆蓋的珠子(如谷胱甘肽瓊脂糖珠子)到孵育混合物中,經過一段時間孵育(通常1-2小時),然後透過離心等方法分離珠子。由於GST融合蛋白會與谷胱甘肽珠子結合,因此如果有任何蛋白與GST融合蛋白相互作用,它們也會被一同拉下。
3.使用相應的洗滌緩衝液清洗珠子,以去除非特異性結合的蛋白。這個步驟可能需要重複幾次以確保清洗乾淨。
4.將與GST融合蛋白相互作用的蛋白從珠子上洗脫出來。這通常透過使用含有高濃度谷胱甘肽的緩衝液來實現,因為谷胱甘肽可以與GST蛋白結合,從而將GST融合蛋白(以及與之結合的蛋白)從珠子上洗脫下來。
四、後續鑑定:
洗脫下來的蛋白可以進行進一步的分析,如SDS-PAGE電泳,然後透過銀染或Western blot來檢測特定的蛋白。如果你已經知道你正在尋找哪個蛋白,你可以使用特定的抗體進行Western blot分析。如果你不知道可能與bait蛋白相互作用的蛋白,你可以將銀染的凝膠切下來,進行蛋白質質譜分析,來鑑定蛋白的身份。
這只是GST pull-down實驗的大致步驟,具體的步驟可能會因為不同的實驗設計和目標而略有不同。
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