請問如何在MaxQuant分析結果中檢視鑑定到的unique peptide的數目?謝謝
MaxQuant是一種廣泛使用的定量蛋白質組學軟體,它能夠分析來自質譜資料的蛋白質和多肽。
在MaxQuant的輸出結果中,可以在"peptides.txt"這個檔案中找到鑑定到的獨特多肽(unique peptides)的資訊。"peptides.txt"檔案包含了每一個被鑑定的多肽的詳細資訊。
每一行代表一個被鑑定的多肽,而"Sequence"列顯示了多肽的氨基酸序列,"Length"列顯示了多肽的長度,"Modifications"列顯示了多肽的修飾。
"Unique (Groups)"列會標記出是否為獨特多肽。如果這一列的值為"+",則說明這個多肽是一個獨特多肽。否則,如果這一列的值為"-",則說明這個多肽不是一個獨特多肽。
你可以透過統計"Unique (Groups)"列中為"+"的行數,來獲取獨特多肽的數量。
請注意,MaxQuant的版本和設定可能會影響輸出結果的格式和內容。如果你不能在"peptides.txt"檔案中找到這些資訊,或者有任何其他的問題,建議你查閱MaxQuant的官方文件或者聯絡MaxQuant的技術支援。
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