代謝組學怎樣解讀資料,據我所瞭解到的,資料分析後會有不同的圖,但是這些圖看不懂
是的,代謝組學資料進行生物資訊學分析後通常會得到多種圖形,不同的圖形表示的資訊也不同,解讀這些圖形可以獲取不同維度的資料資訊:
1.主成分分析(PCA)圖:
這是一種降維方法,用於展示資料的整體分佈和結構。在PCA圖中,每個點代表一個樣本,相似的樣本在圖中的距離較近,而差異較大的樣本距離較遠。可以觀察樣品之間的聚類特點以及可能的離群點。
2.PLS-DA或OPLS-DA分析圖:
這些方法也是降維方法,但與PCA不同的是,它們是監督學習方法。在這些圖中,每個點仍然代表一個樣本,但是,它們根據分類標籤進行顯著性差異的展示。可以觀察不同類別樣品之間的區分程度。
3.載荷圖(Loadings plot):
此圖用於顯示代謝物的貢獻度,可以從中找到對分類影響最大的代謝物。在載荷圖中,每個點代表一個代謝物,其距離原點的遠近表示其對模型的貢獻程度。距離原點較遠的代謝物對分類影響較大,可能具有生物學意義。
4.火山圖(Volcano plot):
火山圖用於展示代謝物之間的顯著性差異。橫座標表示代謝物的變化倍數(如對數值),縱座標表示差異顯著性水平(如負對數P值)。火山圖中位於上方和兩側的點表示顯著差異的代謝物。
5.熱圖(Heatmap):
熱圖用於顯示代謝物在不同樣品中的丰度差異。熱圖中的行表示代謝物,列表示樣品,單元格的顏色表示代謝物在該樣品中的丰度。顏色越深表示丰度越高,顏色越淺表示丰度越低。熱圖可以幫助觀察代謝物在不同樣品之間的表達模式。
根據具體實驗設計和研究目的,還可能需要其他圖形來解讀代謝組學資料。在檢視這些圖形時,關注樣品之間的差異、關鍵代謝物和它們的生物學意義等方面,以獲取有價值的資訊。
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