怎麼看哪個蛋白差異顯著?
要尋找顯著差異的蛋白質,通常需要利用生物資訊學方法進行差異表達蛋白質分析,常用的生信統計方法如t檢驗、方差分析、Wilcoxon等,這些方法將產生每個蛋白質的差異表達值(例如,fold change,log2(fold change)等)以及統計顯著性指標(如p-value或校正後的p-value)。
接下來最重要的一步就是根據研究的要求和標準,設定顯著性閾值,一般來說,較常見的選擇是設定調整後的p-value閾值(如0.05或0.01)或fold change閾值(如2倍或1.5倍),如果得到的p-value小於顯著性水平,就可以認為蛋白質表達差異顯著。
爲了確保結果的可靠性,通常需要進行獨立的重複實驗或採用其他方法進行驗證如Western blotting。
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