PLS-DA/OPLS-DA二維圖:請問您圖中說的,大樣本的R²大於0.2也可以,有參考文獻嗎?

    關於大樣本中 R² 大於 0.2 是否可接受的問題,這主要取決於實際應用和領域。在一些情況下,R² 值大於 0.2 可能被認為是足夠的,特別是在生物學和化學計量學領域,資料的複雜性和噪聲較高時。然而,通常來說,更高的 R² 值意味著模型擬合更好,預測效能更強。


    關於 R² 值的可接受範圍,沒有統一的標準。在實際應用中,應該綜合考慮其他評估指標,如預測性殘差平方和(PRESS)、Q² 值(交叉驗證決定係數)以及模型的穩定性和可解釋性。通常,較高的 R² 和 Q² 值,以及較低的 PRESS 值,表明模型的效能較好。


    值得注意的是,在解釋 OPLS-DA 或 PLS-DA 二維圖時,還應考慮其他因素,如主成分貢獻度、變數的負荷圖以及樣本在得分圖上的分佈等。這些資訊將有助於更全面地評估模型的效能和可靠性。


    總之,關於大樣本的 R² 大於 0.2 是否可接受,這取決於具體的研究背景和實際需求。建議您參考與您研究領域和應用相關的文獻,以瞭解該領域通常接受的 R² 值範圍。


    至於文獻,我推薦閱讀以下文章,可以幫助您瞭解更多關於 PLS-DA 和 OPLS-DA 的資訊和評估方法:


    1.Trygg, J., & Wold, S. (2002). Orthogonal projections to latent structures (O-PLS). Journal of Chemometrics, 16(3), 119-128. DOI: 10.1002/cem.695

    這篇文章詳細介紹了 OPLS 方法的基本原理和應用。


    2.Bylesjö, M., Rantalainen, M., Cloarec, O., Nicholson, J. K., Holmes, E., & Trygg, J. (2006). OPLS discriminant analysis: combining the strengths of PLS-DA and SIMCA classification. Journal of Chemometrics, 20(8‐10), 341-351. DOI: 10.1002/cem.1006

    這篇文章討論了 OPLS-DA 方法的優點,並將其與 PLS-DA 和 SIMCA 分類進行了比較。


    3.Eriksson, L., Trygg, J., & Wold, S. (2008). CV-ANOVA for significance testing of PLS and OPLS® models. Journal of Chemometrics, 22(11‐12), 594-600. DOI: 10.1002/cem.1187

    這篇文章介紹了使用 CV-ANOVA 進行 PLS 和 OPLS 模型顯著性檢驗的方法。


    4.Worley, B., & Powers, R. (2013). Multivariate Analysis in Metabolomics. Current Metabolomics, 1(1), 92-107. DOI: 10.2174/2213235X11301010092

    這篇文章提供了關於在代謝組學中使用多元分析方法(包括 OPLS-DA 和 PLS-DA)的概述。


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