MRM/PRM定量蛋白組學分析：可以問問PRM-MS的圖怎麼看嗎？

在MRM/PRM定量蛋白組學分析中，PRM-MS圖通常是用於定量目標蛋白的。下面是PRM-MS圖的一些常見特徵和解讀：

 

1.離子流圖（Total Ion Current, TIC）：

離子流圖顯示整個質譜掃描期間所有碎片離子的訊號強度總和。TIC可以提供總離子訊號的相對強度，通常用於檢查樣品是否存在雜質或過多的訊號噪聲。

 

2.針對目標蛋白的離子流圖（Targeted Ion Current, TIC）：

TIC是選擇一個特定的m/z視窗，這個視窗包含與目標蛋白特定肽段的碎片離子相關的所有訊號。TIC是PRM-MS定量的關鍵部分，它可以提供目標蛋白的定量資訊。

 

3.色譜峰圖（Chromatogram）：

色譜峰圖顯示在質譜掃描期間，特定m/z視窗的訊號強度隨時間的變化。色譜峰圖是TIC的細化版本，它提供了更精確的資訊，用於測量肽段訊號的強度。

 

4.肽段碎片圖（Fragment Ion Spectrum）：

肽段碎片圖是用於確認蛋白質的身份和鑑定它的特定肽段。它顯示特定肽段的碎片離子訊號的強度和m/z值，透過與已知肽段碎片圖進行比較來確認鑑定。

 

總的來說，PRM-MS圖提供了對目標蛋白的定量資訊，透過解讀離子流圖、色譜峰圖、肽段碎片圖等特徵來獲得更加精確的定量結果，並確認蛋白質的身份和鑑定其特定肽段。

 

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