有沒有人做蛋白質二級結構預測相關的內容。還有就是有沒有做過的大佬給一點建議,謝謝了?

    蛋白質二級結構指的是肽鏈區域性的空間結構,是由主鏈摺疊產生的以氫鍵維繫的有規則的、不對稱的構象,如α-螺旋、β-摺疊、β-轉角和無規則捲曲等,這些不對稱結構使蛋白質分子具有圓二色性。圓二色譜(Circular Dichroism,CD),又稱圓二色光譜,根據待測物的圓二色性分析其立體空間結構,是研究蛋白質二級結構的有力工具。


    圓二色譜分析蛋白質二級結構的基本原理是蛋白質對平面偏振光的左、右吸收係數不同,用平面偏振光照射蛋白質溶液,蛋白質對左、右圓偏振光的吸收係數存在差異,以這種左、右吸收係數差為縱座標,平面偏振光的波長為橫座標,就可以得到該蛋白質的圓二色譜圖。在此光譜曲線中,當左偏振光吸收係數(εL)大於右偏振光吸收係數(>εR)時, 左右偏振光的吸收係數之差Δε為正值,說明該蛋白質為右旋;反之,當εL小於εR時,則得到一個負的圓二色光譜曲線,即被測蛋白質樣品為左旋。


    預測蛋白質二級結構通常涉及到計算生物學方法和機器學習演算法,現有的二級結構預測方法主要有DSSP、PSIPRED、GOR、Phyre2等,不同的方法原理和優缺點都不同,實際應用中可以根據需求進行選擇。在使用機器學習演算法(如支援向量機、隨機森林、神經網路等)構建預測模型時,可以嘗試不同的演算法,並使用交叉驗證等技術評估模型效能。深度學習方法,如摺積神經網路(CNN)和長短時記憶網路(LSTM),在蛋白質二級結構預測方面效果還不錯。如果條件允許,可以透過實驗方法(如圓二色譜、X射線晶體學或核磁共振等)驗證預測結果。實驗驗證有助於確保預測模型的可靠性。


    百泰派克生物科技提供專業的圓二色譜服務用於分析測定蛋白質的空間構型構象。這項技術相較於傳統方法具有以下優勢:

    1. 測定時間短、簡便、高效

    2. 需要樣本量極少,可在稀溶液中測定

    3. 無分子量或分子大小限制

    4. 對二級、三級結構變化高度靈敏,能夠檢測到微小改變


    北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質譜為依託的生物藥物表徵,大分子物質(包括蛋白質、多肽、代謝物)質譜分析以及小分子物質檢測服務。公司採用ISO9001質量控制體系,專業提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務,業務範圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表徵、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信雲分析以及多組學生物質譜整合分析等。7大質量控制檢測平臺,服務3000+企業,10000+客戶的選擇,致力於為您提供優質的生物質譜分析服務!


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