代謝組學FAQ彙總
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需要，常用的非靶代謝資料庫有NIST、Fiehn、HMDB、KEGG、METLIN、MassBank、DrugBank、Lipidmaps等。相關服務:非靶向代謝組分析
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HMDB資料庫不支援批次搜尋、代謝通量搜尋和代謝化合物濃度搜索等，僅限於單個代謝產物搜尋，搜尋效率較低；METLIN資料庫具有大量的MS/MS圖譜，可以獲得代謝物的分子質量和化學結構等資訊。相關服務:代謝組學
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二者在檢測物的性質上存在差別，氣相色譜-質譜聯用GC-MS適用於分析容易氣化的低極性、低沸點的易揮發的代謝物，主要為初級代謝產物；液相色譜-質譜聯用LC-MS不受樣品揮發性和熱穩定性的影響，樣品前處理非常簡單，過濾後直接進樣，可有效分析植物中豐富的次生代謝產物，常用於氨基酸、糖類、醇類、有機
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GC-MS使用的是電子碰撞(EI)；而LC-MS使用的是電噴霧(ESI)或低頻常壓化學電離(APCI)。相關服務:代謝組學
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所有的設計都是爲了實現實驗目的，因此第一步要明確實驗目的：要簡單的進行定性定量檢測？還是篩選差異物、關注特定物質的表達差異、還是查詢代謝通路以及做多組學的關聯分析等？其次進行樣本採集：要檢測什麼物質？樣本怎麼採集、採集多少、用什麼方法採集？最後根據實驗目的選擇合適的實驗平臺和後續分析方案，如
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膜脂或脂肪酸等溶解度較低的代謝物通常在氯仿和水中提取，溶解度較高的代謝物如碳水化合物等一般在甲醇和水進行提取。相關服務:代謝組學
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因為代謝物處在表達的最下游，不同個體間的差異和動態波動較大，所以需要生物學重複來增強資料的可靠性和說服力。相關服務:代謝組學
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樣本檢測前，對儀器進行除錯與矯正，以保證儀器穩定工作；檢測時利用內標和QC進行質控，內標可以用來觀察保留時間是否偏移，並對資料做規一化處理。QC用來反映儀器在樣本檢測中的穩定性。相關服務:代謝組學資料質量分析
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可以從QC、內標保留時間以及物質檢出率等方面進行判斷，QC 穩定、樣品聚類，內標保留時間偏差小，物質的檢出率高等都可以說明實驗沒問題。相關服務:代謝組學資料質量分析
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因為預實驗沒有對資料進行任何處理，而正式實驗時會利用QC篩選物質，QC樣本中檢出率30%(GC-MS)或者20%（LC-MS）的也都會被剔除掉。所以正式實驗檢出物質數量比預實驗少很多。相關服務:代謝組學
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