代謝組學FAQ彙總
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通常這涉及使用穩定同位素標記的內標,該內標以已知濃度加到樣品中。然後將透過 LC-MRM-MS 獲得的分析物和標記化合物之間的響應比插值到標準曲線上,以計算未知樣品中分析物的絕對含量。相關服務:代謝組學
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在先進的 LC-MS 系統的幫助下,透過使用特定的內標 (ISTDs) 嘗試量化目標分子。相關服務:代謝組學
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任何種類的生物樣品(血清、血漿、唾液、組織、尿液、植物提取物和細胞提取物)。如果您有既定的提取代謝物的流程,您可以對其進行處理並將乾燥產物提供給我們。相關服務:代謝組學
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核磁共振:核磁共振具有檢測不損樣品、無需複雜的樣品前處理,使樣品儘可能接近其生理狀態等優點。但是,它的靈敏度較低,尤其是對低丰度的代謝物。 LC-MS:液相色譜和質譜相結合的技術,具有較高的解析度、較高的靈敏度,可以檢測多種代謝物。通常用於檢測小於 1000 Da 的非揮發性極性化合物。 G
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差異代謝物篩選標準:選擇倍數變化≥2和倍數變化≤0.5的代謝物。如果對照組和實驗組之間代謝物的差異大於2倍或小於0.5,則認為差異顯著。如果樣本分組中存在生物學重複,在上述基礎上,選擇VIP≥1的代謝物。VIP 值代表了模型中各組樣本中對應代謝物的差異對分類和判別的影響。一般認為VIP≥1的
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• 我可以比較不同批次的化合物嗎?我可以比較同一樣品中的不同物質嗎?
質譜需要定期維護和校準,因此不同批次之間廣泛靶向代謝組學的定量通常無法直接比較。在質譜中,化合物的電離程度不同,因此無法比較來自同一樣品的不同化合物。相關服務:代謝組學
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液相質譜的檢測範圍應小於1000Da,聚糖、多肽、澱粉、果膠、木質素等經常遇到的大分子物質的分子量不在檢測範圍內。相關服務:代謝組學
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• 如何檢測資料庫中沒有的物質?為什麼我無法檢測到資料庫中有的物質?
如果目標物質不在資料庫中,我們建議購買純化過的標準品,我們可能會為您開發靶向檢測。 如果目標物質在資料庫中,但在樣品中未檢測到,可能有以下原因:1、樣品中不含該物質或該物質含量極低。2. 由於高通量檢測一次掃描數以千計的化合物種類,可能存在阻礙檢測的干擾離子。相關服務:代謝組學
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為避免個體差異導致代謝物檢測差異不準確,代謝組學檢測建議混合樣本,即每個生物學樣本原則上為來自至少3個個體的混合物作為一個生物學重複。相關服務:代謝組學
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為避免在操作過程中新鮮組織樣品代謝物不穩定導致代謝物降解,需要對樣品進行冷凍乾燥,一般採用真空冷凍乾燥法。相關服務:代謝組學
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