代謝組學FAQ彙總
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代謝組學之所以能被用作科學研究的手段,取決於它在生物領域的重要性和作用。1.小分子的產生和代謝是生物有機體的結果。生物體液中代謝物的分析可以更直接準確地反映生物體的病理生理情況。2.基因和蛋白質表達的微小變化將在代謝物上被放大,使檢測更容易。3.代謝組學有一個簡單的代謝組資料庫,遠沒有全基因
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代謝組學檢測的主要方法是 NMR、LC-MS、GC-MS 和高效液相色譜及氣相色譜。最近,高效液相色譜 (hplc) 是最流行的代謝組學檢測技術。透過對一系列樣品光譜的檢測,結合化學模式識別方法,可以確定生物體的病理生理、基因功能、藥物毒性和藥效,且研究人員還可以識別相關的生物標誌物。相關服
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• 用於GC-MS對細菌的無細胞上清液進行代謝組學分析需要對樣品進行處理嗎?如何處理?
這取決於很多因素以及具體的實驗目的。引入GC-MS的任何樣品都需要具有熱穩定性並且還需要揮發,以便在GC柱上分離以進行有效質譜鑑定。如果實驗目的是鑑定揮發物,則可能不需要對樣品進行任何處理。如果是想尋找脂質、脂肪酸、酯類或類似的化合物,則可能需要某種預處理,例如衍生化技術醯化、烷基化和矽烷化
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理想的情況是凍幹並浸漬組織樣品,保持其完整性,這樣樣品預處理不會有問題,並且更容易運輸。此外也可以使用液氮來冷凍組織並儲存在-80℃,寄送時樣品應與乾冰一起運輸。相關服務:代謝組學
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• 進行非靶向代謝組學研究哪種溶劑能為各種代謝物提供最佳的提取?
最好選用70%甲醇。相關服務:非靶向代謝組分析
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• 利用LC-MS進行非靶向代謝組學分析時發現質荷比和保留時間都非常接近的化合物,這種差異是如何造成的?
1、很可能是同位素;2、同一化合物的雙峰(該化合物在特定顆粒中具有不同的形式,因此在色譜執行過程中分裂,產生兩個緊密但不同的峰);3、感興趣的化合物的異構體(相同的分子式,除了一個原子的位置外,結構非常相似);4、不相關的化合物(不太可能,但仍然可能)。相關服務:非靶向代謝組分析
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我們提供的三重四極杆(TSQ Access、Quattro LC)和離子阱(LCQ DECA XP)儀器可用於定量和定性。然而,離子阱儀器在全掃描模式下更加靈敏,並且具有執行提供額外結構資訊的質譜實驗的獨特能力。因此,離子阱通常更適合定性分析。三重四極杆儀器可以在選擇性離子監測 (SIM)
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代謝組學可以在靶向(您應該知道要量化哪些分子)和非靶向(嘗試分析給定樣品中的所有分子)分析中完成。相關服務:代謝組學
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分析必須使用高解析度儀器(QTOF、Orbi-traps)和定量儀器(Triple Quad 或 Qtrap)。相關服務:代謝組學
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在分析中,你嘗試使用高解析度儀器分析給定樣品中所有可能的分子,而在量化時,你只對某些化合物感興趣。相關服務:代謝組學
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