WB結果分子量增加了20kDa,怎麼去磷酸化、去糖基化來驗證翻譯後的修飾
Western Blot(WB)實驗中,若觀察到某蛋白的分子量相比預期增加了20kDa,這可能表明該蛋白經歷了翻譯後修飾。爲了驗證這一點,你可以採取以下步驟:
一、去磷酸化驗證
1.樣品準備:
首先,確保你有足夠的蛋白樣品。
2.選擇適當的磷酸酶:
通常使用鹼性磷酸酶(如Lambdaprotein phosphatase)或其它專門的去磷酸化酶。
3.進行磷酸酶處理:
根據酶的說明書進行操作,通常是在特定的緩衝液中和酶一起孵育樣品一段時間。
4.再次進行Western Blot:
處理後的樣品再次進行WB分析。如果蛋白的分子量減少,接近其預期大小,這表明蛋白質可能經歷了磷酸化修飾。
二、去糖基化驗證
1.樣品準備:
同樣,確保有足夠的蛋白樣品。
2.選擇去糖基化酶:
常用的去糖基化酶包括PNGase F、O-糖酸酶等,這些酶可以去除N-或O-連結的糖鏈。
3.進行去糖基化處理:
根據酶的說明書進行操作,通常需要在特定緩衝液中孵育樣品和酶。
4.再次進行Western Blot:
處理後的樣品進行WB分析。如果蛋白質分子量減少,接近其理論大小,這可能表明蛋白質經歷了糖基化修飾。
在進行這些實驗時,重要的是要對照實驗組(未處理的樣品)和陰性對照組進行比較,以確保實驗結果的準確性。此外,最佳化實驗條件對於獲得可靠的結果至關重要。
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