如何分析蛋白質的糖基化位點以及糖基化後的分子量,預測網站
- 質譜分析：質譜（MS）是確定蛋白質糖基化位點的黃金標準。透過對特定肽段的MS/MS分析，可以鑑定出糖基化的特定位點。
- 免疫印跡：使用特定於糖基化位點的抗體進行檢測。
- 預測軟體和資料庫：如NetNGlyc（預測N-糖基化位點），NetOGlyc（預測O-糖基化位點），GlycoEP等。
- 使用這些工具的步驟通常包括：輸入目標蛋白質的氨基酸序列；選擇糖基化型別（N-或O-糖基化）；執行預測，得到潛在的糖基化位點；評估預測結果，通常這些工具會給出一個置信度得分。
一、分析糖基化位點的方法：
1.實驗方法：
2.生物資訊學預測：
二、糖基化後分子量的預測：
1.理論計算：
知道了糖基化位點及其型別後，可以根據新增的糖鏈的型別和數量估算分子量的變化。
2.質譜測定：
糖基化蛋白質的整體分子量可以透過質譜直接測定。糖基化引起的質量變化可以透過分析糖基化和未糖基化形式的峰值差異來確定。
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