WB測通路蛋白,只測了磷酸化的蛋白,沒有檢測總量,問題大不大?
對於這個問題,答案取決於研究的目標以及實驗的設計。總體上來說,不同時測定蛋白的總量和磷酸化狀態可能對實驗結果的解釋產生一定影響:
1.基素水平的蛋白質表達量
總蛋白檢測可以作為一種控制,瞭解你的目標蛋白在樣本中的基礎表達量。如果你的樣本中沒有總蛋白的檢測,你可能不確定觀察到的磷酸化水平改變是否是由於磷酸化程度的改變,或僅僅是因為蛋白質本身表達量的改變。也就是說,如果一種蛋白質的磷酸化水平看起來較高,這可能是因為這種蛋白質本身就存在更多(而不一定是更多的蛋白質被磷酸化)。
2.結果的定量可比性
如果我們只檢測磷酸化蛋白,而不檢測總的蛋白量,我們可能無法對不同條件下的磷酸化水平進行有效比較。總蛋白檢測為我們提供了一種基線,可以對比不同試驗條件下磷酸化蛋白的水平,這在定量研究中是非常重要的。
3.實驗變異的控制
總蛋白的檢測也可以用作技術控制。如果所有樣本的總蛋白水平一致,那麼任何觀察到的變化都可以歸因於磷酸化水平的變化,而非其它實驗變數。這有助於確保我們觀察到的結果是真實的,不受實驗方法的影響。
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