土壤微生物群落怎樣看菌群差異（比如說某種菌群消失或者新增）用哪種方法看，比較？

研究土壤微生物群落的差異可以採用多種方法，包括高通量測序技術、生物晶片技術、實時熒光定量PCR、培養和鑑定以及功能基因組學等。

如果您的目標是全面瞭解土壤微生物群落的變化，包括菌群的消失或新增，並且您希望獲取儘可能多的資訊，我建議使用“宏基因組測序（Metagenomics）”。因為宏基因組測序分析土壤樣本中所有微生物的遺傳物質，提供關於存在於樣本中的微生物種類和它們的基因功能的詳細資訊。此外，不同於針對特定種羣的方法（如qPCR或16S rRNA基因測序），宏基因組測序可以揭示已知和未知的微生物，這對於發現新的或不常見的微生物種群至關重要。

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