表達出的蛋白跑WB比預測的小，這是為什麼呢？
當蛋白質在Western blot（WB）實驗中跑得比預測的小，可能有以下幾個原因：
1.蛋白質修飾：
蛋白質在細胞內可能會經歷多種修飾，如磷酸化、甲基化、乙醯化等。這些修飾可以改變蛋白質的電荷、空間構象和分子量，從而影響其遷移速度。如果蛋白質發生了修飾，可能會導致其在SDS-PAGE凝膠中遷移速度變慢，使其跑得比預測的小。
2.蛋白質構象：
蛋白質的三維結構也會影響其遷移速度。如果蛋白質處於緊密的構象狀態，可能會受到凝膠孔徑的限制而跑得比預測的小。此外，蛋白質的摺疊狀態也可能影響其與SDS結合的效率，進而影響其遷移速度。
3.蛋白質降解：
蛋白質在細胞內可能會受到蛋白酶的降解。如果蛋白質在取樣、裂解或電泳過程中發生了降解，可能會導致其跑得比預測的小。
4.實驗條件：
實驗條件的不同也可能導致蛋白質跑得比預測的小。例如，電泳電壓、凝膠濃度、電泳時間等因素都會影響蛋白質的遷移速度。如果這些條件不恰當，可能會導致蛋白質跑得比預測的小。
5.分子量標準：
使用不恰當的Maker可能會導致分子量被錯誤估計。
6.其他蛋白異構體：
某些基因可能存在多個異構體，這些異構體的分子量可能與預測的不同。
爲了確定問題的原因，你可以考慮：
1.重新檢查你的蛋白的序列，確保其與你用於Western Blot的抗體是一致的。
2.使用質譜進行蛋白鑑定，確認你觀察到的帶是你感興趣的蛋白。
3.最佳化你的樣品處理步驟，確保樣品的完整性。
4.使用多種分子量的標準來更準確地估計蛋白的分子量。
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