請問非變性凝膠電泳可以使互作蛋白複合物分開嗎？比如複合物AB跑完膠以後，出現其中一個蛋白A的條帶？

非變性凝膠電泳並非旨在分離互作蛋白複合物，但在某些特定條件下，仍有可能實現複合物AB的分離。

非變性凝膠電泳的主要原理是蛋白質在電場中隨電荷和大小而分離。複合物是否能夠在非變性凝膠電泳中分離取決於一些因素，如蛋白質間的相互作用強度、複合物的穩定性、蛋白質分子的大小與電荷等。如果蛋白質間的相互作用較弱，電泳過程可能導致複合物破裂，並在膠上形成單個蛋白質的條帶。然而，如果相互作用較強，則複合物在膠上可能保持結合，不能分離。

如果你的目標是破壞複合物，並在凝膠上觀察到每個單獨的蛋白質，更適合採用變性凝膠電泳（如SDS-PAGE）。在這種方法中，蛋白質與SDS及其他變性劑結合，使複合物破裂同時阻止其重新結合，如此一來蛋白質在膠上分離成各自的條帶。您還可以嘗試使用更弱的分離條件（如減少電泳時間、改變緩衝體系等），從而提高非變性凝膠電泳中蛋白質複合物的分離效果。