死細胞如何影響ScATAC測序資料？

細胞活力低會導致Chromium控制器中的細胞恢復不可靠，進而導致測序目標缺失和結果欠佳。此外，死亡或凋亡細胞釋放的環境DNA片段會增加背景噪音，從而影響資料質量。爲了最大限度地提高單細胞專案中有用的測序資料量，必須儘量減少死細胞的存在。我們建議細胞活力超過90%，最低為70%。存活率低於70%的樣品可能會進行死細胞去除 (DCR)。DCR至少需要106個細胞，並且之前無需使用磁珠進行處理。




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