ATAC-seq資料的預期重複率是多少？

重複讀長通常是文庫製備過程中PCR重複的結果，在預處理步驟中，這些讀長被標記並刪除。 由於Tn5 酶的插入是隨機的，因此PCR重複代表偽影，可能會影響下游分析。低重複率 (< 5-10%) 是最佳選擇，雖然稍高的重複率仍然可以接受 (< 20-30%)，但較高的百分比可能表明樣品製備步驟存在問題。




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