覆蓋度和讀取深度有什麼區別?ATAC測序資料需要多少reads?
覆蓋率和讀取深度是衡量文庫測序情況的指標。從視覺上看,覆蓋率是從水平方向來說的,而讀取深度是從垂直方向來說的。覆蓋率或覆蓋寬度回答了“測序覆蓋了多少樣本?”。它可以表示為測序讀數覆蓋的鹼基百分比,例如95%的覆蓋率表明樣本中95%的鹼基已經測序。 讀取深度或測序深度表示檢測到特定核苷酸的reads數量。這可以作為鹼基響應可靠性的有力指標。低讀取深度也可能表示樣本中的特定區域表現不佳。通常,如果區域/鹼基響應有30個讀取對映,那麼它的讀取深度是30倍。讀取深度也可以表示為平均讀取深度,這是在考慮測序的鹼基總數及其單個深度的情況下計算的。通常,排序越深,讀取的內容越多。
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