ATAC測序資料中，有哪些重要的質控指標？

庫複雜性：庫複雜性代表文庫中正在測序的讀長的數量，它與細胞的數量呈正相關。在ATAC測序中，細胞太少會導致過度轉座（或過度消化）產生大量的小片段，而細胞過量會造成轉座不足產生大量非常大的片段。 鹼基質量：鹼基響應的質量由分數（PHRED分數）定義，該分數是使用響應核苷酸出錯的機率計算的。PHRED分數越高，質量越高，出錯的機率越低。 比對：一旦鹼基響應被編譯為reads，就必須將它們準確地與基因組比對。兩個指標很好地反映了測序反應的質量。校準率表示對映到基因組上的reads的百分比，最佳值超過90%。比對的質量，或reads與基因組特定區域的匹配程度，被稱為MAPQ分數。最高的MAPQ值（255）用於表示單個區域對應的唯一reads，最低的MAPQ值（0）用於表示匹配到許多區域的reads。




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