fast質控結果中read1的質量和GC含量圖分佈為什麼出現異常?

1由於10X特殊的實驗方式，測序結果read1從起始1bp至16bp為barcode序列，緊接著是10bp（或12bp）的UMI序列，再接著是ploy(dT)VN，由於序列的特殊結構，導致26bp（或28bp）之後的鹼基測序質量和GC分佈抖動，這是正常現象，而且10x Cell Ranger在分析時read1只用到前26bp（或前28bp）的序列資訊，後面序列的資訊不會對結果產生影響。

相關服務: