如何判定單細胞測序的資料質量?
可以從以下幾個方面進行判斷:1、捕獲到的細胞數量:捕獲到的細胞數量越多,證據越充分;2、細胞中的平均reads數:一般大於3萬是比較好的資料;3、細胞中的中位基因值:該值的大小與不同的組織樣本有關,如癌細胞中可能數值較高;4、測序的飽和度:一般大於50%即可;5、測序得到的reads比對到高質量細胞的佔比:如果細胞活性偏低,這個數值會偏低。
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