SWATH蛋白組學

SWATH是一種基於質譜的資料非依賴性的掃描採集模式，主要應用於蛋白質組定量、和宿主蛋白分析等研究中。百泰派克生物科技提供SWATH定量蛋白組學服務。

SWATH技術

SWATH（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions）是一項全新的質譜採集模式技術，屬於一種DIA (Data Independent Acquisition)技術。SWATH將整個質譜掃描質量範圍分為若干小視窗，依次對每個視窗的所有離子進行碎裂，使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描並採集所有母離子的碎片離子進一步進行二級MS/MS分析。SWATCH技術可以鑑定複雜樣品中的所有分子，包括低表達蛋白和低丰度的被修飾蛋白，且具有高通量和精準度高的特點。

SWATH蛋白組學

SWATH蛋白組學主要是利用SWATH技術進行定量蛋白質組研究。與label free技術一樣，SWATH技術可以不用進行樣品的標記而對樣品蛋白進行定量。SWATH定量蛋白組首先是對細胞或組織等樣品進行蛋白提取和純化，接著對純化蛋白進行還原開啟蛋白二硫鍵，並使用Trypsin等蛋白酶將蛋白酶切成多肽片段，多肽片段混合溶液經過LC-MS色譜質譜串聯分析技術進行分離和SWATH質譜分析，最後透過軟體分析質譜資料從而對蛋白質組進行鑑定和定量。SWATH對儀器掃描速度和檢測精度要求很高，常用作SWATH分析的儀器平臺為AB SCIEX Triple-TOF 5600-plus或同系列更高階版本的質譜儀。



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