宏蛋白質組學分析
宏蛋白質組學是大規模的定性和定量分析蛋白質以分析環境中的微生物群落的一門學科。百泰派克生物科技提供基於質譜的宏蛋白質組學分析服務。
宏蛋白質組學
宏蛋白質組學也稱為環境蛋白質組學,是透過對環境菌群中某一時刻的所有蛋白的詳盡描述,從而揭示微生物表型資訊的一門學科。宏蛋白質組資料集的分析提供了有關微生物群落的結構、功能和動態的資訊,這對於提高對微生物的招募、營養資源競爭、代謝活動和整個群落的防禦系統分佈的理解至關重要。例如,針對人類口腔微生物組的宏蛋白質組學研究發現人類口腔中有50個細菌屬,該結果與人類微生物組計劃的結果一致。宏蛋白質組學可以用於分析微生物的共生關係、宿主-病原體的關係和宿主之間的關係。
宏蛋白質組學分析
宏蛋白質組學分析方法
成功的宏蛋白質組學測量取決於三個要素:從環境樣品中有效提取蛋白質,在檢測之前分離蛋白質或多肽,最後是對蛋白質和多肽進行高通量的清晰鑑定。當前,宏蛋白質組學分析常常使用基於液相色譜的分離技術以及基於質譜的肽段鑑定技術進行。採用自下而上的策略,首先使用胰蛋白酶將蛋白質消化成肽,然後進行色譜分離,並隨後透過質譜或串聯質譜進行分析。該方法可以對建立了基因組的環境微生物群落進行研究。
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