抗原表位:揭開細胞死亡與癌症治療新紀元的序幕
最近,在《自然》旗下的《細胞死亡與分化》雜誌上,發表了一篇科學家找到觸發細胞程式性死亡的開關的文章:美國加州大學戴維斯分校綜合癌症中心的一個研究小組確定了CD95受體上一個可導致細胞死亡的關鍵表位。CD95受體(也被稱為Fas)是一種位於細胞膜上的死亡受體,當被啟用時,它們會釋放出導致細胞自毀的訊號。研究人員表示,他們找到了細胞毒性Fas訊號以及CAR-T抗腫瘤功能的最關鍵表位。這可能會提供一條以腫瘤中的Fas為靶點的治療途徑。
抗原表位(antigenic epitope),也被稱為抗原決定簇,是抗原分子上可以被特異性抗體識別和結合的化學官能團。每一個抗原可能含有多個不同的抗原表位,每個表位都可以與一個特異的抗體結合。抗原表位分析是一種用於確定抗體或T細胞受體識別的抗原分子上具體哪一部分(表位)的技術。這在疫苗設計、疾病診斷、免疫治療以及基礎免疫學研究中都是一個關鍵步驟。抗原表位可以是蛋白質或多肽的連續(線性)序列,也可以是由蛋白質摺疊後空間上鄰近的非連續氨基酸殘基構成的構象表位。
圖1
抗原表位分析在癌症治療中的應用:
在癌症治療中,抗原表位分析的重要性在於能夠幫助識別那些可以成為免疫系統攻擊目標的癌細胞特異性抗原。瞭解這些特異性表位對於設計靶向癌細胞的免疫療法(如CAR-T細胞療法、癌症疫苗)是至關重要的。
1.癌症疫苗開發:
透過分析表位來設計能夠啟用針對癌細胞的免疫反應的疫苗。
2.免疫檢查點抑制劑:
發現可以增強免疫系統對癌細胞攻擊的新表位,可能有助於設計更有效的免疫檢查點抑制劑。
3.細胞治療:
設計具有特異性T細胞受體的T細胞,這些T細胞能識別並靶向癌細胞的特定抗原表位。
傳統的抗原表位分析方法是將蛋白質抗原降解為小片段,然後透過測序確定抗體的結合位點。其他技術,如ELISA法、噬菌體隨機肽庫、X-射線晶體學、核磁共振技術、氫氘質譜技術和生物資訊學等也為表位分析提供了強大的工具。
基於質譜的蛋白測序技術是分析抗原線性表位的強有力方法,該方法還可用於透過探測具有高親水性、表面可及性、靈活性和抗原性的區域來識別潛在的線性表位區域。
與線性表位相比,構象表位更難以繪製,氫氘交換質譜可以透過檢測抗體結合對抗原蛋白氫氘交換速率的影響,從而鑑定出抗原的構象表位。在氫氘交換過程中,與抗體結合的抗原區域會因結合的遮蔽效應而顯示出較慢的交換速率,透過對比抗原單獨與D2O反應和抗原與抗體結合後與D2O反應的結果,可以確定哪些肽段的交換速率受到了抗體的影響,從而確定與抗體結合的抗原構象表位。
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