10X單細胞測序中GEM是什麼意思？

在10x Genomics單細胞測序中，GEM（Gel Bead-in-Emulsion）是一種關鍵的元件，指的是將凝膠珠包裹在微滴（乳狀液）中的結構。GEM技術是10x Genomics單細胞測序中實現單細胞分離和mRNA捕獲的核心步驟。

凝膠珠上帶有預合成的寡核苷酸探針，包含一個獨特的細胞條形碼、一個UMI（獨特分子識別符號）以及一個聚A尾部分。當一個細胞和一個凝膠珠被一起封裝在一個微滴（油包水乳狀液）中時，細胞破裂釋放mRNA，mRNA與凝膠珠上的寡核苷酸探針結合。這一過程使得每個捕獲到的mRNA分子都帶有特定的細胞條形碼和UMI，從而可以在後續的資料分析中準確地追溯到原始的單個細胞。

GEM技術對於10x Genomics單細胞測序的成功至關重要，因為它允許在單細胞水平上分析成千上萬個細胞，為深入瞭解生物系統提供了前所未有的高解析度資訊。