蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白質鑑定

百泰派克生物結合MALDI-TOF質譜系統與LC-MS/MS質譜系統，提供專業準確的蛋白膠點、膠條、IP樣品，CO-IP樣品蛋白鑑定服務。可鑑定的樣品包括：1D-SDS PAGE分離的蛋白膠條，2DE PAGE中的蛋白膠點，蛋白表達產物，免疫共沉澱（Co-IP）樣品。其中，蛋白質樣品的鑑定前處理過程嚴格按照Nature Methods發表的文章：Universal sample preparation method for proteome analysis進行，保證鑑定試驗中得到更高的肽段覆蓋率。質譜鑑定的原理則是基於鳥槍法（Shot-gun）：將蛋白條帶或者蛋白溶液酶切成肽段混合物，經高效液相色譜分離得到若干較為簡單的組分，進入高解析度質譜儀中進行分析。檢索軟體根據二級質譜資訊與相應的資料庫比對，結合匹配度打分及錯配過濾，可得到肽段的確切序列，進而拼接出各蛋白的完整序列，從而實現對蛋白的鑑定。

蛋白質質譜鑑定流程






基於鳥槍法（shot-gun）LC-MS的蛋白鑑定流程




關於樣品

1D SDS PAGE /2D PAGE gels樣品：
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain樣品均可進行蛋白的鑑定試驗；
2. 銀染的樣品有可能與後續的質譜分析不相容，我們推薦您使用下面的產品或者實驗步驟進行銀染實驗：
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
3. 銀染的樣品請不要進行脫色處理

液體樣品（In solution format）：
1. 假如樣品中蛋白量＞10ug，我們對樣品的緩衝體系沒有要求；
2. 假如樣品中蛋白量＜10ug，樣品準備過程中儘量減少SDS等表面活性劑的使用，並注意降低鹽濃度；
3. 提交樣品過程中，注意提供樣品的緩衝體系和樣品中蛋白的預估含量；
Co-IP樣品：
1. 如果您洗脫的樣品需要跑膠，請按照1D SDS PAGE樣品準備要求準備樣品即可；
2. 如果您直接提交洗脫樣品，我們推薦使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 緩衝體系進行蛋白洗脫，保證洗脫緩衝體系與後續的質譜實驗相容；
樣品運輸：
1. 我們推薦您將樣品凍幹後進行運輸，凍幹樣品中蛋白非常穩定。
2. 液體樣品推薦乾冰運輸，短途運輸冰袋也可以。

注意事項： 利用質譜進行蛋白樣品的鑑定，在樣品準備過程中需佩戴手套和頭套，儘量避免自身角蛋白（keratin）對樣品的汙染。

研究案例

該專案是中國科學院生物物理所一位老師將她的Co-IP的樣品寄給我們進行蛋白鑑定。得到的部分結果如下圖所示：







蛋白膠點、膠條、IP樣品蛋白鑑定研究案例


從圖中可以看出，我們提供的結果報告中包含鑑定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鑑定出的肽段資訊，鑑定出的肽段的修飾資訊以及對鑑定到的蛋白的詳細描述。

中/英文專案報告：

在技術報告中，百泰派克會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告，報告包括：

1. 實驗步驟（中英文）
2. 相關的質譜引數（中英文）
3. 質譜圖片
4. 原始資料
5. 鑑定的蛋白質詳細資訊

蛋白膠點、膠條、IP樣品質譜鑑定一站式服務

您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務完成：樣品處理-上機分析-資料分析-專案報告

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