蛋白質定量標籤規格是什麼
蛋白質定量標籤，如Tandem Mass Tag（TMT）和Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation（iTRAQ），是用於質譜分析中的化學標籤，它們允許同時定量比較多個樣本中的蛋白質表達。這些標籤透過共價鍵連線到樣本中的肽段上，然後在質譜分析過程中透過釋放一個標記離子來進行檢測和定量。
蛋白質定量標籤的常見型別包括：
1、TMT標籤
每個TMT標籤包含三個部分：一個質量報告基團（質量不同，用於檢測和定量）、一個平衡基團（確保所有標籤的總質量相同，以實現等離子異位質譜法的分析）、一個反應基團（與肽段的氨基端或賴氨酸側鏈反應）。
圖1.TMT試劑的化學結構通式
TMT標籤規格：TMT標籤有多種規格，包括TMT0、TMT2plex、TMT6plex、TMT10plex、TMT11plex和最近開發的TMT16plex和TMTpro系列。數字指的是每個標籤套裝可以標記的不同樣本數，例如TMT10plex可以用於同時比較10個不同的樣本。
2、iTRAQ標籤
iTRAQ標籤也包含報告基團、平衡基團和反應基團。iTRAQ標籤透過與肽段的N末端和賴氨酸側鏈的氨基反應，將標籤附加到肽段上。
圖2. iTRAQ試劑的化學結構
iTRAQ標籤規格：iTRAQ標籤通常有4plex和8plex兩種規格，允許同時定量分析四個或八個樣本。
每種型別的標籤有其特定的規格，如反應條件、標記效率、質譜檢測的靈敏度等。這些規格對於實驗的設計和資料的解釋至關重要。例如，同位素標籤需要具備足夠的質量差異以便在質譜中區分，而化學標籤則需要有高的標記效率和穩定性。
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