tmt標記定量蛋白質組學檢測應用
- 生物標誌物發現：透過比較健康和疾病狀態下的樣本，TMT標記定量蛋白質組學可以用於識別潛在的生物標誌物。這些標誌物可以用於疾病的早期診斷、病情監測或預測治療反應。
- 疾病機理研究：TMT技術能夠揭示特定疾病狀態或病理條件下蛋白質表達和調控的變化，有助於理解疾病的分子機制和發病過程。
- 藥物靶點篩選和驗證：透過分析藥物處理前後的蛋白質表達差異，TMT技術可以幫助識別和驗證新的藥物靶點，加速藥物開發過程。
- 治療反應和藥物毒性研究：TMT標記定量蛋白質組學可以用於監測特定治療的效果，透過比較治療前後蛋白質的變化來評估治療效果，同時評估潛在的藥物毒性。
- 系統生物學和多組學研究：TMT技術與其他組學技術（如轉錄組學、代謝組學）結合，可以提供系統級的生物資訊，揭示覆雜生物過程和疾病狀態下的分子網路。
TMT (Tandem Mass Tag) 標記定量蛋白質組學是一種先進的質譜技術，用於定量分析不同樣本中的蛋白質表達差異。這種技術的核心是使用TMT標籤來標記蛋白樣本。在此過程中，來自不同條件或處理的蛋白樣本被分別與不同的TMT標籤結合。這些標籤質量不同，但結構相似，這允許在質譜分析中區分不同樣本中的相同蛋白。
圖1. 基於TMT的蛋白質組學服務工作流程
TMT特點及應用
與無標記定量相比：TMT利用新增到樣品中的不同標記來區分和定量蛋白質，從而可以在一次執行中同時分析和比較多個樣品。 TMT的資料採集模式是單次執行，可同時對多達16個樣本進行定量。與使用獨特的基於肽的資料依賴性採集（DDA）模式的傳統無標記定量相比，TMT 提供更少的缺失值和更完整的資料記錄。無標記定量在檢測多批次樣品時通常會遇到重現性差的問題，而與無標記技術相比，TMT 可以透過分級分離識別更多蛋白質。然而，由於 DDA 掃描模式的限制，低丰度蛋白質的代表性可能不足。此外，動態範圍壓縮的存在可能會導致量化值低於實際值，從而使準確量化差異表達的蛋白質變得具有挑戰性。
因此，基於標記的定量，例如TMT，更適合比較經過不同處理或不同時間點、具有相似背景（例如相同物種和樣本型別）的小樣本（最多16個）之間的共享蛋白質。然而，它不適合鑑定樣品中是否存在蛋白質。TMT標記定量蛋白質組學技術在生物醫學研究、藥物開發和疾病診斷中有著廣泛的應用:
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