怎樣確定泛素化位點
泛素化（Ubiquitination）是一種蛋白質的翻譯後修飾過程，透過這一過程，一個名為泛素（ubiquitin）的小蛋白質被附加到其他蛋白質上。確定泛素化位點是一個複雜的過程，大致可以透過以下幾種方法進行：
1.生物資訊學預測：
使用專門的軟體和資料庫來預測泛素化位點。例如，UbPred、Ubpred等工具可以用來預測泛素化位點。這些工具通常基於已知的泛素化位點和它們的序列特徵來進行預測。
2.實驗驗證：
1）質譜分析
透過質譜（Mass Spectrometry，MS）技術來鑑定蛋白質樣本中的泛素化位點。在這個過程中，通常會使用特定的酶切割蛋白質，然後分析其肽段，從而確定泛素化的具體位置。
2）免疫沉澱：
使用特異性抗體（例如抗泛素抗體）進行免疫沉澱實驗，以富集泛素化蛋白，然後透過西方印跡（Western blot）或質譜分析來鑑定。
3）突變分析：
將預測的泛素化位點上的氨基酸進行突變，通常是將賴氨酸（Lysine，K）突變為其他氨基酸，然後觀察這些突變對蛋白質泛素化水平的影響，以驗證這些位點是否真的參與泛素化。
圖1.泛素化修飾研究案例
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