氨基酸N端測序及其Edman降解法概述
氨基酸N端測序是一種用於確定蛋白質或多肽序列從N端(即氨基端)開始的幾個氨基酸殘基的順序的技術。這種方法在蛋白質鑑定和特性分析中非常重要,尤其是在生物化學和分子生物學研究中。
Edman降解法是最常用的氨基酸N端測序方法,這種方法透過逐步化學降解的方式,一次僅移除序列中的一個氨基酸,從而確定蛋白質或多肽的氨基酸順序。其過程大致如下:
1.標記N端氨基酸:
首先,使用特定的化學試劑(通常是Edman試劑,即酚異硫氰酸)與多肽或蛋白質的N端氨基酸反應。這個反應會形成一個穩定的標記化合物。
2.切除標記氨基酸:
接著,透過一種特殊的化學方法從多肽鏈上切除這個標記的氨基酸。切除的氨基酸是一個穩定的衍生物,可以透過高效液相色譜(HPLC)等技術進行分析和鑑定。
3.重複過程:
然後對剩餘的多肽或蛋白質重複這個過程,每次切除新的N端氨基酸。透過逐步重複這個過程,可以一步步確定整個多肽或蛋白質的序列。
圖1.Edman測序實驗流程圖
需要注意的是,Edman降解的效率不是100%,這意味著隨著測序深度的增加,訊號會逐漸減弱。因此,該方法通常只能用於確定蛋白質的前20-30個氨基酸。對於長鏈蛋白質或想要確定整個序列的情況,通常需要結合其他方法,如質譜法。
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